南方医科大学学报

作者：彭昂惠,李昭强,张燕,冯德龙,郝冰涛

目的优化非交联染色质免疫共沉淀及其二代测序（Native ChIP-seq）技术，简化操作步骤，得到高质量ChIP-seq数据。方法裂解细胞，MNase切割DNA释放核小体，用组蛋白修饰的特异性抗体将组蛋白与DNA的复合物进行免疫共沉淀，蛋白酶K消化后进行DNA纯化，染色质免疫共沉淀（ChIP）产物用Tn5转座酶建库与传统建库两种方法进行文库构建并测序。结果与传统建库方法相比，Tn5转座酶建库经过Tn5片段化后直接进行目的DNA的扩增，操作简单，更加省时，效率更高；IGV可视化信号分布峰图显示两种建库方式获得的富集峰基本相同；两种建库方法获得的测序数据中，Tn5转座酶建库比传统建库获得更多的富集峰；Tn5转座酶建库后结果显示重复性良好，信噪比达到50%以上。结论Tn5转座酶建库能提高建库效率并得到更好的数据质量，适用于组蛋白修饰的检测，为表观遗传研究提供更好的技术选择。

来源：2019年第06期

《南方医科大学学报》期刊编辑部

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