南方医科大学学报

作者：曾玉梅,王思思,封慕茵,邵钟铭,袁建玲,申志华,揭伟

目的分析甲基转移酶SETD2 表达改变对人鼻咽癌（NPC）细胞中蛋白表达谱的影响并富集差异信号通路。方法提取SETD2基因敲除细胞株CNE1SETD2-KO和野生型细胞CNE1WT的总蛋白，利用Tandem Mass Tag（TMT）标记蛋白质定量技术和串联质谱分析技术筛选出差异表达蛋白质，应用GO数据库对差异表达蛋白质进行注释和富集，应用KEGG数据库进行差异蛋白质涉及信号通路富集。结果以表达倍数（FC）≥1.2倍且P<0.05为筛选标准，SETD2基因敲除的CNE1细胞鉴别出2049个差异表达蛋白质，其中904个表达上调，1145个表达下调。GO功能注释结果表明，SETD2敲除后在生物过程（细胞过程及调节，细胞运动、代谢过程及细胞组分的生物合成）、分子功能（催化活性及分子结合、转录因子活性）和细胞组分（胞膜、细胞器、大分子复合物）等具有特征性。KEGG信号富集结果表明SETD2 敲除主要影响与肿瘤关系密切的信号有MAPK、PI3K-Akt、Ras、Rap1、mTOR、Hippo、HIF-1、Wnt、AMPK、FoxO、ErbB、p53、JAK-STAT等。结论SETD2敲除后显著改变了NPC细胞中蛋白质表达特征并影响多条与肿瘤关系密切的信号通路，研究结果为NPC的发病机制和治疗标靶筛选提供了参考。

来源：2019年第10期

《南方医科大学学报》期刊编辑部

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