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国内刊号：44-1627/R
国际刊号：1673-4254
发布日期:
作者：周烨真,张世豪,陈嘉仪,万成松,赵 卫,张 宝
目的 分析新型冠状病毒SARS-CoV-2的进化、变异情况。方法 从GISAID、NCBI中下载相关病毒全基因组序列，运用生物信息学软件MEGA-X、BEAST、TempEst等软件，构建基因组进化树，推测病毒的时间进化信号，计算病毒出现的tMRCA时间，分析病毒进化的选择压力。结果 基因组进化树显示SARS-CoV-2与蝙蝠冠状病毒Beta CoV/bat/Yunnan/RaTG13/2013、bat-SL-CoVZC45、bat-SL-CoVZXC21和SARS-CoV等病毒共同构成冠状病毒β属的Sarbecovirus亚属。现在的病毒序列有微弱的时间进化信号，tMRCA平均时间为73 d，95%可信区间（38.9~119.3 d），与BetaCoV/bat/Yunnan/RaTG13/2013病毒不具正性时间进化信号，与bat-SL-CoVZC45和SARS-CoV具有强的正性时间进化关系。病毒在流行期间存在变异，主要是净化选择压力。 结论 病毒SARS-CoV-2可能出现在2019年11月左右，来源于蝙蝠相关冠状病毒。结果将有助于研究病毒SARS-CoV-2的溯源、进化，对疾病进行正确防控具有指导意义。
来源：2020年第02期
《南方医科大学学报》期刊编辑部
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