南方医科大学学报

作者：王 信, 王 健, 郭文静, 周 瀛, 孙 超, 李志军, 陈琳洁, 潘新兰

关键词：原发性干燥综合征,肠道菌群,16SrDNA,高通量测序,

目的 探索原发性干燥综合征（pSS）与健康人之间肠道菌群是否存在差异。方法 收取18例符合纳入标准的女性pSS患者的粪便样本，其中9例为病情活动组（A组）、9例为病情不活动或低活动组（B组），另外收取10例健康人的粪便（C组）。收集每份粪便样品的细菌总DNA，PCR扩增，针对16SrDNA基因的V3~V4区进行illumina hiseq 2500高通量测序，得到3组的肠道菌群生物信息数据，随后结合文献智库信息挖掘进行组间OTU分析、样品多样性分析、样品组间显著性差异分析及LEfSe分析。结果 肠道菌群多样性比较：α多样性（Alpha diversity）指数分析，Shannon指数在A组和B组间、Simpson指数在A组和B组间及A组和 C组间差异存在统计学意义（P<0.05）；菌群结构比较：将3组分别进行序列分析，在门水平上3组均主要有 4 个菌门组成，分别是：厚壁菌门（Firmicutes），拟杆菌门（Bacteroidetes），放线菌门（Actinobacteria），变形菌门（Proteobacteria），在属水平上3组均主要有4个菌属组成，分别是：大芬戈尔德菌属（Finegoldia），普雷沃菌属（Prevotella），链球菌属（Streptococcus），棒状杆菌属（Corynebacterium_1），在门水平和属水平上分析显示3组肠道菌群主要菌门和主要菌属两两比较差异无统计学意义（P>0.05），但Streptococcus属在3组之间比较，差异具有统计学意义（P<0.05）；肠道菌群结构的差异分析：肠道菌群 16S V3~V4 区组间显著性差异分析，在属水平上，3 组间相比，在 Alloscardovia 属、Bacteroides 属、Barnesiella 属 、Butyricicoccus 属 、Facklamia 属 、Faecalibacterium 属 、Lachnospiraceae_FCS020_group 属 、Lachnospiraceae_ND3007_group属、Lachnospiraceae_UCG-001属、Lachnospiraceae_UCG-004属、Lachnospiraceae_UCG-008属、Ruminococcaceae_UCG-002属、Streptococcus属之间存在统计学差异（P<0.05）；在Coprococcus_1属存在显著性差异（P=0.005，P<0.01）。3组间肠道微生物进行高维生物标识和揭示基因组特征的分析，差异存在统计学意义（P<0.05）。结论 pSS患者与健康人之间的肠道菌群多样性存在一定差异，在主要菌门水平和菌属水平上虽无显著性差异，但在Streptococcus属等一些特定细菌比例有显著差异；3组肠道菌群在16S V3~V4区组间差异具有统计学意义，提示菌群结构的差异在pSS的发病中起一定作用。

来源：2020年第07期

《南方医科大学学报》期刊编辑部

查看南方医科大学学报杂志2020年第07期