南方医科大学学报

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国内刊号:44-1627/R

国际刊号:1673-4254

南方医科大学学报杂志2021年第9期:非酒精性脂肪性肝病患者的肝组织差异蛋白的定量分析:基于iTRAQ技术

发布日期:

作者:朱雅莉, 章述军, 阳 成, 薛 薇, 张 佳, 李佳俊, 赵金秋, 徐 静, 黄文祥

单位:重庆医科大学附属第一医院感染科,重庆 400016

关键词:非酒精性脂肪肝;蛋白组学;差异性蛋白;生物信息学,

目的 应用蛋白质组学在非酒精性脂肪性肝炎(NASH)肝脏组织中筛选差异蛋白,寻找关键的作用靶点。方法 收集符合纳入标准的肝脏组织,通过 HE 染色病理切片筛选出非酒精性脂肪性肝炎样本(NASH组)3例和正常对照样本3例。提取NASH组及正常对照组的肝脏蛋白,使用iTRAQ试剂对多肽进行标记进行液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)检测,用蛋白质鉴定软件Mascot2.3.02比对UniProt蛋白数据库搜索鉴定,应用GO数据库对差异表达蛋白质进行注释和富集,应用KEGG数据库进行差异蛋白质涉及信号通路富集。实时荧光定量PCR(qPCR)检测显著差异表达蛋白对应的mRNA表达水平。结果 NASH组和对照组相比,以差异倍数(>1.2或<0.8)且P2.0或<0.5)且P<0.05的25个显著差异表达蛋白进行筛选,共有6个蛋白与蛋白组学的结果趋势一致,包括5个下调蛋白:Jumonji 蛋白(JARID2)、莱伯西林样蛋白(LCA5L)、突触素1(SYN1)及胶原α-1(XIII)链(COL13A1)、FYVE,RhoGEF和PH结构域蛋白5(FGD5),以及1个上调蛋白:谷胱甘肽S-转移酶Mu 4(GSTM4)。结论 iTRAQ技术和生物信息学方法在NASH肝脏组织筛选出差异表达蛋白648个,其中JARID2、SYN1、COL13A1、FGD5、GSTM4可能是NASH的关键靶向蛋白。

来源:2021年第9期

《南方医科大学学报》期刊编辑部

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