南方医科大学学报

作者：张河元, 陈南辉, 王晓红, 高白云, 凌木安, 陈 果, 吴志明, 李宇同, 钟伟枫, 潘 斌

单位：广东省梅州市人民医院泌尿外科，广东 梅州 514021；南方医科大学南方医院泌尿外科，广东 广州 510515； 南方医科大学第三附属医院肾内科，广东 广州 510630；暨南大学附属第一医院泌尿外科，广东 广州 510630；广州市第十二人民医院泌尿外科，广东 广州 510630；中山大学肿瘤防治中心泌尿外科，广东 广州 510060

关键词：前列腺癌；转移；加权基因共表达网络分析；枢纽基因；TCGA,

目的 通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）挖掘并验证前列腺癌转移的关键枢纽基因。方法 对前列腺癌全基因组芯片GSE6919进行主成分分析（PCA），通过R语言分析差异表达基因（DEGs）；利用WGCNA构建基因共表达网络并筛选关键基因；在 TCGA 公共数据中分析基因表达量及其与患者预后的关系；设计和验证针对转移相关的关键基因HNRNPA2B1的小分子干扰片段，通过MTT、流式细胞术、克隆形成、Transwell等实验验证其对前列腺癌细胞系生长、凋亡、克隆形成、迁移和侵袭的影响。结果 PCA分析显示癌转移组和原位及癌旁组明显分开聚类，基因表达差异显著。WGCNA分析得到与癌转移组密切相关的模块，与干细胞分化、氨基酸代谢及免疫反应密切相关。进一步筛选得到与前列腺癌发生相关的（BDH1、PAK4、EXTL3）和转移相关的（NKTR、CTBP2、HNRNPA2B1）6个枢纽基因，在TCGA数据库中有表达差异，且与患者的总生存期相关。Western blotting结果显示HNRNPA2B1小分子干扰成功；干扰片段转染PC3及LNCap细胞，MTT实验结果显示沉默HNRNPA2B1可抑制前列腺癌细胞的生长，流式细胞术结果显示沉默HNRNPA2B1可诱导细胞凋亡，克隆形成实验显示沉默HNRNPA2B1可抑制其克隆形成，Transwell实验显示沉默HNRNPA2B1显著抑制前列腺癌细胞的迁移和侵袭（P<0.05）。结论 发现前列腺癌发生相关的BDH1、PAK4、EXTL3和转移相关的NKTR、CTBP2、HNRNPA2B1 6个枢纽基因，为前列腺癌调控机制的研究提供了新思路。

来源：2021年第11期

《南方医科大学学报》期刊编辑部

查看南方医科大学学报杂志2021年第11期