南方医科大学学报

作者：高俊杰, 杨丹丹, 曹若雪, 潘雪珊, 夏 俊

单位：蚌埠医学院检验医学院肿瘤基础研究与临床检验诊断重点实验室，生化与分子生物学教研室，安徽 蚌埠 233030；连云港市第二人民医院检验科，江苏 连云港 222000

关键词：网络药理学；生物信息学；天然虾青素；肾透明细胞癌；胎盘生长因子,

目的 基于网络药理学和生物信息学研究天然虾青素（AST）治疗肾透明细胞癌（KIRC）的分子作用机制。方法 利用PharmMapper数据库检索AST的作用靶点，TCGA数据库获得并筛选KIRC癌组织和癌旁组织中的差异基因，Cytoscape软件对靶基因进行分析并构建“药物-靶点”网络图，String数据库构建可视化PPI网络，对核心作用靶点进行GO富集分析。接着，对筛选出的核心靶点胎盘生长因子（PGF）进行单基因生物信息学分析，采用CCK-8法验证AST对KIRC细胞活性的影响，分子对接技术验证AST与PGF结合情况，RT-qPCR和Western blot验证AST对靶基因mRNA和蛋白表达的影响。结果 分析得到AST作用靶点278个，KIRC相关作用靶点1081个，AST治疗KIRC的核心作用靶点7个，其中核心靶点PGF在KIRC中表达增高（P<0.001）且与预后不良相关（HR=1.37，P=0.043）；分子对接显示AST与PGF的结合能为-5.43 kcal/mol；CCK-8显示当AST浓度为50 μmol/L时即可以抑制KIRC细胞的增殖且AST浓度越高抑制作用越显著；RT-qPCR结果显示，AST处理KIRC后PGF的mRNA表达水平显著降低；Western blot结果显示，经AST处理后KIRC中PGF的蛋白表达受到了明显抑制。结论 AST可以抑制KIRC的增殖并抑制其细胞中PGF的表达。

来源：2021年第12期

《南方医科大学学报》期刊编辑部

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