南方医科大学学报

作者：杨雪佳, 李玉杰, 吴登强, 马义丽, 周素芳

单位：国家生物靶向诊治国际联合研究中心//广西生物靶向诊治重点实验室//广西肿瘤靶向诊治协同创新中心//广西生物靶向诊治研究人才小高地，基础医学院生物化学与分子生物学教研室，广西医科大学，广西 南宁 530021

关键词：肝纤维化；肝硬化；肝细胞癌；ATP1B3；ENAH,

目的 筛选与肝细胞癌（HCC）预后、进展和临床诊断相关标记物。方法 分析来自癌症基因组图谱数据库（TCGA）和基因表达综合（GEO）的TCGA-LIHC、GSE84432、GSE14323和GSE63898数据集。利用GEO2R和edge R包获得各疾病类型之间共同差异基因（DEG），并对DEG进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。将DEG在TCGA-LIHC中正常和癌组织进行差异表达验证分析，挑选在HCC中上调基因。利用R语言进行生存分析、受试者工作特征（ROC）曲线分析、基因与患者临床特征关系分析。再通过RT-qPCR验证15对临床HCC和癌旁组织中基因的差异表达。结果 数据库挖掘共获得118个共同DEG，挑选出2个基因：ATP酶Na+/K+转运亚基Beta 3（ATP1B3）和肌动蛋白调节器（ENAH），其表达随疾病进展升高。结合TCGA-LIHC数据集生存分析发现两者高表达与HCC患者不良预后显著相关（P<0.05）。ROC曲线分析ATP1B3和ENAH的AUC值分别是0.821和0.933。ATP1B3高表达与晚期病理T分期、Stage和Grade相关（P<0.05），而ENAH高表达仅与晚期病理Grade有关（P<0.05）。RT-qPCR结果发现，ATP1B3和ENAH在临床HCC组织中表达上调（P<0.05）。结论 ATPIB3和ENAH有望成为肝脏疾病恶化和肝细胞癌的不良预后标志物。

来源：2022年第6期

《南方医科大学学报》期刊编辑部

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