南方医科大学学报

作者：孙敬杰, 卢 鹏, 管莎莎, 刘淞淞

单位：中国人民解放军总医院海南医院肿瘤内科，肝胆外科，海南 三亚 572013

关键词：胰腺癌；分子亚型；异质性；单细胞测序,

目的 探讨胰腺癌的异质性和肿瘤细胞分子亚型鉴定新方法，鉴定胰腺癌发展过程中的特征基因。方法 分析GSE155698数据集中16例胰腺癌组织单细胞测序数据，初步聚类后，根据各细胞EPCAM基因的表达情况分离胰腺癌细胞，再聚类、分群后鉴定特征基因，进行通路GO和KEGG通路富集分析，并进行拟时序分析。提取癌症基因组图谱179例胰腺癌患者和正常胰腺组织基因表达库中171例正常人基因表达数据、临床信息及预后情况，结合人类蛋白表达图谱蛋白表达情况对各亚型关键基因进行验证。最后通过细胞功能实验验证CEACAM5、LGALS1、CENPF对胰腺癌细胞的增殖、侵袭与迁移等功能的影响。结果 对16例胰腺癌样本48 570个细胞进行分析后发现，细胞总共被聚类为22群，其中包含5群胰腺癌细胞。这些胰腺癌细胞被分为3群：亚型1、亚型2和亚型3，分别具有完全不同的基因表达模式和功能。亚型1胰腺癌细胞的特征基因主要富集于蛋白代谢过程的负调节、铁死亡和抗原提呈相关通路；亚型2胰腺癌细胞的特征基因主要于肽合成过程、翻译和核糖体相关通路；亚型3胰腺癌细胞的特征基因主要富集于ATP代谢过程、糖酵解/葡萄糖生成和细胞周期相关通路。亚型2和亚型3可能是由亚型1发展而来，亚型3可能是胰腺癌细胞发育的最终状态。各亚型的关键特征基因CEACAM5、LGALS1、CENPF的表达情况也在发育轨迹中展现了不同状态。基因和蛋白表达层面均显示各亚型的关键特征基因CEACAM5、LGALS1、CENPF在胰腺癌中高表达，且与患者的不良预后相关，当下调CEACAM5、LGALS1、CENPF的表达后，胰腺癌细胞的增殖（P<0.05）、迁移（P<0.05）和侵袭（P<0.05）能力均被抑制。结论 胰腺癌细胞有较强的异质性，基于CEACAM5、LGALS1、CENPF基因表达可鉴定肿瘤细胞发展过程中的不同分子亚型，且影响胰腺癌细胞的增殖、侵袭和转移。

来源：2023年第9期

《南方医科大学学报》期刊编辑部

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