南方医科大学学报

作者：成佳聪, 李智慧, 刘 鳐, 李 成, 黄 鑫, 田颖鑫, 沈富兵

单位：成都医学院检验医学院，药学院，四川 成都 610500

关键词：TAB1蛋白；PML蛋白；生物信息学；蛋白-蛋白对接；免疫共沉淀,

目的 通过生物信息学方法预测早幼粒细胞白血病蛋白与TAK1结合蛋白的相互作用，并通过免疫共沉淀方法进行实验验证。方法 使用Rosetta软件，采用比较建模的方法，构建TAB1蛋白的三维模型；在PDB数据库中检索PML蛋白二级结构，并解析其晶体结构和三维结构。Zdock3.0.2软件进行PML与TAB1的蛋白-蛋白对接，并提取最佳构象进行对接模型的分子结构分析。α-MMC处理的M1炎性巨噬细胞，利用免疫共沉淀技术检测两种蛋白的相互作用。结果 以PML的6IMQ为对接部位时，PML蛋白与TAB1蛋白能形成3个盐桥、6个氢键和6个疏水作用；以PML的5YUF为对接部位时，PML蛋白与TAB1蛋白能形成1个氢键、3个静电相互作用和9个疏水作用，两种对接模式皆能形成良好的分子对接和相互作用；在α-MMC处理4 h后，其PML-IP组的细胞裂解沉淀液中分别能检测到显著的PML和TAB1阳性蛋白条带。结论 PML蛋白与TAB1蛋白能发生较强的相互作用。

来源：2024年第1期

《南方医科大学学报》期刊编辑部

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