国内刊号:44-1627/R
国际刊号:1673-4254
发布日期:
作者:裴蓓, 张艺, 魏思源, 梅语, 宋标, 董港, 温子昂, 李学军
单位:1.安徽中医药大学第二附属医院,安徽 合肥 230000;2.南京医科大学第一临床医学院,江苏 南京 210000
关键词:肠上皮化生,致病基因,转录组学,生物信息学,
基金:安徽省重大疑难疾病中西医协同攻关项目(0708-2021)
目的 探讨肠上皮化生(IM)的潜在关键致病基因。 方法 收集2022年1月~6月在安徽中医药大学第二附属医院脾胃科就诊的21例IM患者,以及同期在我院体检中心接受胃镜检查的21例健康受试者。对所有参与者均行胃镜及病理检查,收集胃组织样本进行转录组学测序以筛选疾病相关差异基因,并通过生物信息学分析明确其生物学功能。同时采用实时荧光定量PCR对结果进行验证。 结果 通过转录组学测序,最终获得了1373个差异基因,其中827个上调的mRNA和546个下调的mRNA。根据差异基因的显著性与平均表达量对其进行了排序,从中选取了6个前20的上调基因进行验证,RT-PCR结果显示,与正常组相比,AGMAT、CCL25、FABP1、CDX1、SPINK4和MUC2表达水平显著上调(P<0.05)。 结论 AGMAT、CCL25、FABP1、SPINK4、CDX1和MUC2可能是诊断肠上皮化生的潜在生物学标志物,参与了IM的发生、发展,对疾病的预测及诊断有一定的价值。
来源:2024年第5期
《南方医科大学学报》期刊编辑部