南方医科大学学报

作者：任自敬, 周佩洋, 田静

单位：1.湖北医药学院附属襄阳市第一人民医院神经内科，湖北 襄阳 441000；2.湖北省帕金森病临床医学研究中心，湖北 襄阳 441000

关键词：帕金森病,血浆,长链非编码RNA,生物信息学分析,酪氨酸羟化酶,

基金：湖北省科技计划重点研究专项(2023BCB140);湖北省自然科学基金(2022CFB341);襄阳市第一人民医院创新科技项目(XYY2023QT09)

目的 探索外周血浆中与帕金森病（PD）诊疗相关的关键基因和长链非编码RNA（lncRNA）。 方法 收集6例PD患者和6例健康对照者的外周血血浆样本。采用竞争性内源性RNA（ceRNA）芯片技术检测mRNA和lncRNA的表达，运用生物信息学方法对差异表达的基因进行分析。将DElncRNAs上游或下游10 kb内转录的DEmRNAs定义为DElncRNAs潜在的可顺式调控的靶基因。构建PD特异性蛋白质-蛋白质相互作用网络。利用差异lncRNAs与mRNA及已知的microRNA构建ceRNA网络。采用MPP+处理SH-SY5Y细胞建立PD细胞模型，验证关键lncRNA的功能。 结果 PD患者与健康对照者间有316个基因和986个lncRNA的表达存在差异（P<0.05）。通过GO和KEGG富集分析对差异表达的mRNA和lncRNA潜在的可顺式调控的靶基因进行了功能注释，预测了差异表达的mRNA和lncRNAs与microRNA的靶向关系，并根据差异表达的lncRNA的上调或下调分别构建了ceRNA网络。基于网络分析，推测lnc-MTG2-1∶1、lnc-CTSD-5∶1、lnc-PCCA-3∶1、lnc-VTCN1-3∶1、lnc-ZNF25-7∶1和lnc-DAZ3-1∶1可能是PD的关键lncRNA。在MPP+诱导的PD细胞模型中，lnc-CTSD-5∶1的表达变化最显著（P<0.01），且其沉默有助于恢复酪氨酸羟化酶的蛋白表达水平。 结论 PD患者血浆中的lncRNA表达模式发生改变，本研究发现了新的DEGs和DElncRNAs，为探索PD的发病机制和开发潜在的生物标志物提供了新的线索。

来源：2024年第11期

《南方医科大学学报》期刊编辑部

查看南方医科大学学报杂志2024年第11期