南方医科大学学报

作者：谭茹雪, 包晓樟, 韩亮, 李朝晖, 田男

单位：1.浙江中医药大学生命科学学院，浙江 杭州 310053；2.吉林大学中日联谊医院 神经外科，吉林 长春 130031；3.吉林大学中日联谊医院 神经外科，吉林 长春 130031

关键词：脑膜瘤,HOXA9,DNA甲基化,CpG位点,诊断,预后,

基金：2024年浙江省基础公益研究计划项目(Y24H160094);浙江中医药大学2023年校级研究生科学研究基金项目(2023YKJ06);2024年吉林省自然科学基金(YDZJ202401231ZYTS)

目的 探讨同源异形盒基因（HOXs）在脑膜瘤中的甲基化模式，筛选对脑膜瘤复发风险分层有临床指导意义的HOXs基因，建立预测模型并评估其预测效能。 方法 利用GEO数据库下载脑膜瘤相关数据集。通过甲基化差异分析和ROC曲线分析筛选有预后评估价值的HOXs基因，再通过Cox回归分析、分子特征分析对特征基因的临床应用价值进行验证。进一步筛选差异CpG位点并评估其预测效能，通过Lasso-cox回归分析建立预测模型，根据cut off值将患者分成高、低风险组并进行分析。最后通过甲基化特异性PCR（MS-PCR）在细胞和组织水平验证差异CpG位点的甲基化水平，并纳入脑膜瘤组织样本验证该模型的预测效能。 结果 HOXA9甲基化水平在脑膜瘤中显著上调（P<0.001），且具有较高诊断效能（AUC=0.884）。验证分析表明HOXA9甲基化是影响脑膜瘤患者总生存期的独立危险因素（P<0.01），与脑膜瘤恶性程度和不良预后正相关（P<0.05），且基于HOXA9甲基化水平的分组方法在预测患者复发和生存时间时比WHO分级精度更高。筛选出的CpG位点cg03217995和cg21001184对脑膜瘤诊断的AUC均大于0.8，预测脑膜瘤患者复发的AUC均大于0.6。构建的两位点联合预测模型cut off值为1.226，以此分组的患者临床特征均有显著性差异（P<0.001），并且该模型预测评分是脑膜瘤的独立预后因素（P<0.05）。MS-PCR结果显示，位点cg03217995和cg21001184甲基化水平在脑膜瘤细胞中升高（P<0.0001），在不同WHO分级患者间无统计学差异。临床样本分析表明联合模型有较高预测效能（AUC=0.857），预测状态与患者真实临床进展结果高度一致。 结论 HOXA9甲基化是脑膜瘤预后不良的有效预测指标，基于其CpG位点的联合预测模型有望成为恶性进展风险病例早筛的新方法。

来源：2024年第11期

《南方医科大学学报》期刊编辑部

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