国内刊号:44-1627/R
国际刊号:1673-4254
发布日期:
作者:庞金龙, 赵新丽, 张振, 王豪杰, 周星琦, 杨玉梅, 李姗姗, 常小强, 李锋, 李娴
单位:1.蚌埠医科大学药学院;2.安徽省生化药物工程技术研究中心,安徽 蚌埠 233030
关键词:多聚蛋白-2,黑色素瘤,预后,生物信息学,免疫浸润,
基金:安徽省重点研究与开发计划资助项目(202104g01020017);安徽省高校科研项目(2024AH051219);安徽省高校科研项目(2024AH051249)
目的 采用生物信息学探讨多聚蛋白-2(MMRN2)抑制皮肤黑色素瘤(SKCM)生长和转移的影响。 方法 从GEO数据库获得SKCM患者的临床信息,比较正常组织和黑色素瘤中MMRN2的表达差异;通过STRING数据库获得和MMRN2互相作用蛋白,构建蛋白网络,利用GEPIA2.0数据库下载SKCM中MMRN2相关性基因,对交集基因进行GO/KEGG功能富集分析;利用“timeROC”包处理数据,使用“stats”包和“car”包,分析MMRN2和SKCM的临床相关性;使用survival包进行比例风险假设检验并进行Cox回归分析筛选独立预后因素并构建临床列线图;利用GSCA数据库和ssGSEA算法分析MMRN2与免疫细胞浸润的相关性;利用Spearman分析研究MMRN2和血管生成相关基因的相关性;集落克隆、transwell、划痕实验检测SKCM细胞的增殖和转移能力;采用HE染色观察病理学变化;Kaplan-Meier曲线观察生存时间;ELISA实验检测黑色素瘤细胞上清中GM-CSF、CXCL9、TGF-β1的表达水平。 结果 MMRN2在SKCM转移瘤中的水平升高(P<0.001);在STRING数据库中获得30个互作分子构建蛋白互作网络,和GEPIA2.0数据库中获得的基因取交集得到15个共同基因,进行GO/KEGG分析主要是是endothelium development、cell-cell junction等。在SKCM患者中MMRN2高表达的患者预后更差,MMRN2的水平在pathologic T satge、breslow depth、melanoma ulceration中差异具有统计学意义(P<0.05),免疫浸润结果显示,MMRN2和24中免疫细胞丰度呈正相关(P<0.001),并与肿瘤成纤维细胞和内皮细胞具有较强的正相关性(P<0.001),MMRN2的表达水平和大多数血管生产基因的表达水平呈正相关,和KCNJ8、SLCO2A1、NRP1、COL3A1的表达相关性较强(P<0.001);敲低MMRN2后,SKCM细胞B16F10的增殖(P<0.01)、侵袭和迁移能力减弱(P<0.01),重塑免疫微环境(P<0.001),进而抑制黑色素瘤的转移。 结论 多聚蛋白-2可能成为治疗SKCM的新靶点,为SKCM的诊断和治疗提供新的策略与思路。
来源:2025年第7期
《南方医科大学学报》期刊编辑部