国内刊号:44-1627/R
国际刊号:1673-4254
发布日期:
作者:何榕茂, 方泽扬, 张芸芸, 吴友谅, 梁世秀, 计涛, 陈科全, 王斯琪
单位:1.广州医科大学附属第一医院,消化内科,广东 广州 510120;2.广州医科大学附属第一医院,变态反应科,广东 广州 510120;3.中山大学附属第六医院胃肠外科,广东 广州 510000
关键词:溃疡性结肠炎,铁死亡,免疫浸润,PPARG,T细胞,
基金:国家自然科学青年基金(82500630);国家自然科学青年基金(82300032);广东省基础与应用基础研究基金省市联合基金(2023A1515110161);广州市科学技术局基础研究计划基础与应用基础研究专题项目(2024A04J3537);广州市科技局基础研究计划市校(院)联合资助“登峰医院”项目(2024A03J1145);广州医科大学科研能力提升提升计划
目的 探讨铁死亡相关基因在溃疡性结肠炎 (UC)诊断和预测中的的价值。 方法 本研究从GEO数据库中选择UC数据集,筛选差异表达基因(DEGs),进一步从“FerrDb“数据库中筛选与铁死亡相关的DEGs并进行功能分析。通过构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)筛选枢纽基因,采用CIBERSORT评估UC与对照组的免疫浸润水平差异,以及利用训练集验证枢纽基因在UC诊断中的价值。进一步通过构建UC小鼠模型,利用实时荧光定量PCR (qPCR)检测小鼠结肠中枢纽基因的表达情况。 结果 筛选到76个与铁死亡相关的差异表达基因。功能富集分析显示铁死亡和缺氧途径显著富集。蛋白相互作用网络确定了10个枢纽基因,经数据库验证有9个枢纽基因在UC中高表达。经免疫细胞浸润分析显示,27种细胞类型在UC中明显升高(P<0.05),免疫检查点相关基因均与枢纽基因PPARG相关性最强(P<0.05)。进一步通过训练集验证P4HB、PPARG、STAT3在疾病中预测价值最佳(P<0.05)。通过构建小鼠UC模型验证结肠组织中枢纽基因的表达水平,RT-PCR显示与对照组相比,UC模型中PPARG表达明显降低,P4HB、STAT3表达明显升高(P<0.05)。 结论 铁死亡相关基因在UC的诊断预测中具有重要价值。
来源:2025年第9期
《南方医科大学学报》期刊编辑部